Pada 24 Julai 1995, Mladic didakwa oleh Mahkamah Jenayah Antarabangsa kerana melakukan pembunuhan , jenayah terhadap kemanusiaan , dan pelbagai jenayah perang termasuk pembunuhan di Sarajevo.Pada 16 November 1995 , tuduhan diperluaskan kepada tuduhan pembunuhan, jenayah terhadap kemanusiaan , dan jenayah perang atas serangan terhadap PBB di Srebrenica pada bulan Julai 1995.

Mladic dipercayai bersembunyi di Serbia , di Bosnia atau di Republika Srpska . Mladic pernah dilaporkan menghadiri perlawanan bola sepak antara China dan Yugoslavia di Belgrade pada Mac 2000. Dia masuk ke stadium melalui pintu masuk VIP dan dikawal 8 orang pengawal bersenjata. Dia juga pernah dilihat di Moscow, di Tesalonika dan Athens untuk menutup jejaknya.

Laporan lain menyatakan Mladik berlindung di bunker perang di Han Pijesak, tidak jauh dari Sarajevo, atau di Montenegro. Pada Februari 2006, laporan perisikan tentera Serbia telah bocor dan disiarkan oleh akhbar Serbia Politika. Kononnya dia disembunyikan oleh Tentera Republika Srpska dan Tentera Rakyat Yugoslavia sehingga 1 tahun 2002. Pada Jun , Perhimpunan Kebangsaan Serbia meluluskan undang-undang bekerjasama dengan ICTY di Den Haag. Maka Tentera Darat Yugoslavia ,Nebojša Pavković meminta Mladic meninggalkan Gunung Povlen, dekat Valjevo , selepas mereka kehilangan jejak.

Mladic pergi bersembunyi selepas penangkapan Slobodan Milošević pada tahun 2001, setelah hidup bebas di Serbia.

Pada bulan November 2004, Britain mengakui bahawa Mladic gagal ditangkap dan didakwa di mahkamah .Ketika berada di Sukan Olimpik di resort ski Sarajevo ,Mladic dikawal oleh empat pengawal. Walaupun ada surat perintah Den Haag, Mladic terus bermain ski. Kemudian NATO menghantar pasukan komando untuk menangkap Mladic tetapi Mladic bergerak di bawah tanah.

Sehingga musim panas 2004 tentera rakyat telah menyembunyikan dan melindungi Ratko Mladic.

Pada bulan Jun 2005 akhbar The Times menuduh Mladic telah menuntut $ 5 juta (£ 2750000) "pampasan" untuk diberikan kepada keluarganya dan pengawalnya jika ia menyerahkan diri ke ICTY di Den Haag.

Kononnya pada 21 Februari 2006 , Mladic telah ditangkap di Belgrade dan sedang dipindahkan ke Tuzla dan ke mahkamah jenayah perang PBB di Den Haag. Penangkapan ditolak oleh kerajaan Serbia . Kerajaan Brazil dan sumber-sumber Serbia mendakwa pada 22 Februari 2006 bahawa Mladic ditangkap di Romania , dekat Drobeta-Turnu Severin. Namun, Jaksa ICTY Carla Del Ponte menyangkal rumor bahwa Mladic telah ditangkap.

Pada 16 Jun 2010, keluarga Ratko Mladic memohon agar Mladic diisytiharkan mati dan bolehlah isterinya menjual semua harta peninggalan.Permintaan itu ditolak oleh pihak berkuasa Serbia.